許多酵母菌和霉菌能引起免疫受損病人的機會性感染，甚至是威脅生命的感染。它們很少累及防御功能完整的人。酵母菌往往引起真菌血癥以及皮膚和其他組織局灶性病變。白吉利絲孢酵母菌和Blastoschizomyces capitatus特別容易侵害中性粒細胞減少的病人。平滑念珠菌能引起真菌血癥，尿路感染，偶爾可引起肺炎或其他局灶性病變，并且對唑類藥或兩性霉素B的抗藥性大于白念珠菌。嬰兒和接受脂質(zhì)高營養(yǎng)靜脈輸液治療的虛弱成人易患糠秕馬拉色真菌血癥。過去認為馬內(nèi)菲青霉菌是東南亞艾滋病病人的機會性病原菌，在美國也曾有過病例報道。馬內(nèi)菲青霉菌引起的皮膚病變可能與接觸傳染性軟疣相似。特別是中性粒細胞減少病人，多種環(huán)境霉菌都可引起類似于侵襲性曲霉菌病，包括棱霉菌和足分枝菌所致的局灶性血管炎病變。特異性診斷需作培養(yǎng)和種的鑒定，這很重要，因為這些病原真菌并不是對任何一種抗真菌藥物都敏感的。例如，足分枝菌屬是典型的抗兩性霉素B的真菌。用于治療這一類機會性真菌感染的最佳抗真菌治療方案尚有待確定。
