基礎醫(yī)學院下設行政、教學科研、學生工作三個辦公室，按中醫(yī)基礎學科類和西醫(yī)基礎學科類共設15個教研室以及2個直屬實驗中心（中西醫(yī)基礎實驗教學中心、中醫(yī)基礎實驗研究中心)。擁有碩士學位授予點6個（中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)臨床基礎、中醫(yī)醫(yī)史文獻、方劑學和中西醫(yī)結合基礎)；4門省級精品課程（中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)診斷學、中國醫(yī)學史醫(yī),學,全,在,線,提,供m.f1411.cn、中西醫(yī)結合生理學)；1個國家中醫(yī)藥管理局重點學科（中醫(yī)各家學說)、1個廣西規(guī)劃和建設博士點學科（中醫(yī)醫(yī)史文獻)、2個校級重點學科（中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)診斷學)；1個廣西重點實驗室（中醫(yī)基礎研究實驗室)、1個廣西高校教學示范中心（中西醫(yī)基礎實驗教學中心)，2個國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥科研二級實驗室（分子生物學實驗室、神經(jīng)行為學實驗室)。
基礎醫(yī)學院在發(fā)展歷程中涌現(xiàn)有一批國內、區(qū)內名老中醫(yī)如林沛湘、班秀文、秦家泰教授等。經(jīng)過建校四十七周年以來，學院現(xiàn)已發(fā)展為擁有教職工123人，專任教師101人，其中教授15人，副教授34人，講師41人，助教11人；教師隊伍中有博士學位21人，碩士學位44人；學科帶頭人6名，學術帶頭人4名，后備學科帶頭人10名；碩士生導師25名。廣西高校教學名師1人，廣西壯族自治區(qū)優(yōu)秀教師1人，八桂名師1人；國醫(yī)大師1人，廣西名老中醫(yī)1人，廣西名中醫(yī)5人。近年來，又采取外引、內培、以老帶新等方式進一步加強師資隊伍建設，使師資素質不斷提高，結構不斷優(yōu)化。
在教學資源方面，學院擁有基礎醫(yī)學實驗室11個（解剖學、組織學與胚胎學、寄生蟲學、生物學、生理學、生物化學、微生物學與免疫學、公共衛(wèi)生學、中醫(yī)保健美容、中醫(yī)實驗教學中心、中醫(yī)實驗研究中心)。2000年在同類院校中率先建成兩個具有國內先進水平的電腦化生理機能實驗系統(tǒng)實驗室；2001年建成了獨具特色的人體生命科學館和中國醫(yī)學史展館醫(yī),學,全,在,線,提,供m.f1411.cn。在學院的教學、科研及對外學術交流活動、科普宣傳等方面發(fā)揮了重要的作用。2002年加強了生物化學教研室分子生物學實驗室的建設，促進了我院教學、科研工作的引向深入；2003年學院繼續(xù)重點投入，建立了國內領先的微觀形態(tài)學互動實驗室和解剖實驗教學平臺設備，這些現(xiàn)代設施的投入使用，為我院教學水平的提高奠定了堅實基礎。另學院各教研室擁有專業(yè)參考書籍、出版刊物近五千冊，可供網(wǎng)絡查閱的各類電子圖書數(shù)萬冊。
基礎醫(yī)學院作為主要的教學單位，承擔學院各專業(yè)層次共38課程的教學工作，年均課時數(shù)約4.8萬課時。多年來，基礎醫(yī)學院注重教學管理和教學研究工作，不斷提高師資隊伍的業(yè)務素質，促使教師改進教學方法和應用新的教學手段，切實提高教學質量。目前，大部分課程教學已從單一傳統(tǒng)的模式向多媒體教學過渡。在中醫(yī)教學發(fā)展方面，既重視經(jīng)典的理論課程設置和傳統(tǒng)教學方法，也結合引入現(xiàn)代教學理念、技術，從現(xiàn)代角度，客觀闡述中醫(yī)學理論基礎。同時，通過中醫(yī)實驗教學中心、中醫(yī)實驗研究中心的教學、科研工作開展，進一步發(fā)展與延伸中醫(yī)學理論體系的內涵。近4年來，學院承擔各級科研項目共112項，其中國家級3項，省部級項目22項；獲教學成果獎7項，其中國家級三等獎1項，區(qū)級二等獎4項，三等獎2項。
基礎醫(yī)學院將不斷開拓進取，為培養(yǎng)更多合格的高等中醫(yī)藥人才做出新貢獻。
