公開(公告)號
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CN1544652A
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公開(公告)日
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2004.110
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申請(專利)號
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CN200310108154.4
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申請日期
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2003.10.27
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專利名稱
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頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片
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主分類號
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C12Q1/68
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分類號
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C12Q1/68
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分案原申請?zhí)? |
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優(yōu)先權(quán)
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申請(專利權(quán))人
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上海第二醫(yī)科大學(xué)附屬第九人民醫(yī)院
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發(fā)明(設(shè)計)人
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陳萬濤;張萍;張志愿;邱蔚六;張陳平;竺涵光;孫堅;李江
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地址
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200011上海市制造局路639號
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頒證日
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國際申請
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進入國家日期
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專利代理機構(gòu)
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上海東亞專利代理有限公司
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代理人
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董梅
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國省代碼
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上海;31
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主權(quán)項
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一種頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片,由與頭頸鱗癌顯著相關(guān)的一些基因序列構(gòu)成相應(yīng)的寡核苷酸探針,制備成小型化診斷用芯片,其特征在于,所述探針為下列寡核苷酸序列,共代表39條基因,包括:EMPCEACAM5、NA、ZNF185、ACPP、COL1A2、HPGD、TGM3、ITGA6、NMU、OPN、SCEL、COL1ACOL4A2、KRT13、PPL、PP1CYP3A5、PLAU、IL1RN、PITXMAI、BLNK、FNCOL5A2、MMPMFAP2、SERPINH2、COLAAKRT4、LAGY、C5ORF13、FAPA、SPINK5、KIAA0790、DUSP5、PTHLH、GPX3、CEACAM1。
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摘要
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本發(fā)明涉及一種頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片,以及一種頭頸鱗癌分子分類診斷方法。一種頭頸鱗癌分子分類診斷用小型化寡核苷酸芯片,由與頭頸鱗癌顯著相關(guān)的一些基因序列構(gòu)成相應(yīng)的寡核苷酸探針,制備成小型化診斷用芯片,所述探針為下列寡核苷酸序列,共代表39條基因。本發(fā)明采用頭頸鱗癌分子分類專用的小型診斷芯片替代傳統(tǒng)的高通量大芯片,顯著降低了成本,簡化了操作過程。該專用芯片的獲取系使用多種統(tǒng)計分析標準,多種統(tǒng)計學(xué)方法相結(jié)合:A和B基因群的交集和COM框架(C基因群)。通過綜合使用這些方法,保留不同統(tǒng)計方法敏感性高的優(yōu)點(參數(shù)/非參數(shù)/混合參數(shù),差異平均值/平均值的差異),同時克服了不同統(tǒng)計學(xué)方法所帶來的假陽性率困擾。
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國際公布
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