Nature Biotech:解碼中國倉鼠基因組
在Alfred Pühler教授的領導下,來自比勒菲爾德大學生物技術(shù)中心(CeBiTec)的基因組研究人員,成功地對中國倉鼠(Chinese hamster)的基因組進行了測序。研究人員現(xiàn)將他們的結(jié)果發(fā)表了在國際期刊《自然生物技術(shù)》(Nature Biotechnology)雜志上。
CeBiTec科學主任Thomas Noll相信,他們獲得的數(shù)據(jù)將引起科學和工業(yè)團體的興趣。制藥行業(yè)一直利用來自中國倉鼠的細胞培養(yǎng)物來生成諸如醫(yī)用抗體等生物藥品!霸谖磥,解碼的倉鼠基因組將大大推動利用這些細胞系來生產(chǎn)藥物制劑,”Noll說。
中國倉鼠基因組包含11對染色體。解碼這樣的大型基因組需要生成大的數(shù)據(jù)集,然后利用生物信息學對其進行處理。為了更容易地分析生成的數(shù)據(jù),比勒菲爾德大學的研究人員和他們的同事,應用了一種全新的程序來對基因組單條染色體進行分類。CeBiTe的Karina Brinkrolf博士完成了對倉鼠染色體的測序。在新一代測序儀器的幫助下生成了超過14億短DNA序列醫(yī).學全.在.線網(wǎng)站m.f1411.cnNature Biotech:解碼中國倉鼠基因組。
該項目的領導者Alfred Pühler教授說:“這一項目的主要挑戰(zhàn)是隨后將這些短DNA序列拼接在一起,形成一條總的染色體序列!边@項工作只能用功能強大的計算機來完成。該項目的參與者、生物信息學專家Alexander Goesmann博士說:“我們必須完成新的CeBiTec計算機集群,應用新軟件才能確定這一基因組序列。通過解碼倉鼠基因組序列,比勒菲爾德大學的生物信息學取得了新的突破!本哂写蠹s23億個堿基,中國倉鼠基因組序列的大小可與人類基因組媲美。
Alfred Pühler認為這項研究是CeBiTec研究工作的一項里程碑:“解碼這一倉鼠基因組標志著一項重要的CeBiTec計劃成功地完成。這一倉鼠序列可在公共領域獲得,供全世界研究利用!边@一計劃為當前針對中國倉鼠細胞培養(yǎng)物開展研究奠定了基礎,大大提升了比勒菲爾德大學的地位。維也納國家資源和生命科學大學、澳大利亞工業(yè)生物技術(shù)中心已同意開展進一步的研究項目。這將讓比勒菲爾德大學處于極好的位置,為這一激烈競爭的研究領域繼續(xù)做出貢獻。