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生物化學(xué)-實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)

生物化學(xué):實(shí)驗(yàn)指導(dǎo):◎<福林—酚試劑法(Lowry 法)>◎<溫度、pH、激動(dòng)劑和抑制劑對(duì)酶活性的影響>◎<基因組DNA的提取及鑒定>※m.f1411.cn<福林—酚試劑法(Lowry 法)>項(xiàng)目性質(zhì):研究性實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí):4分組人數(shù):1人實(shí)驗(yàn)原理:蛋白質(zhì)中的氨酸等與酚試劑之磷鉬酸、磷鎢酸作用產(chǎn)生藍(lán)色化合物,其顏色深淺與蛋白質(zhì)含量成正比。福林—酚法測(cè)定蛋白質(zhì)的反應(yīng)原理可分為兩個(gè)步驟:1.在堿性溶液中,蛋白質(zhì)與銅離
 

<福林—酚試劑法(Lowry 法)>

<溫度、pH、激動(dòng)劑和抑制劑對(duì)酶活性的影響>

<基因組DNA的提取及鑒定>

 
     m.f1411.cn<福林—酚試劑法(Lowry 法)>

    項(xiàng)目性質(zhì):研究性

    實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí):4

    分組人數(shù):1人

    實(shí)驗(yàn)原理:

    蛋白質(zhì)中的氨酸等與酚試劑之磷鉬酸、磷鎢酸作用產(chǎn)生藍(lán)色化合物,其顏色深淺與蛋白質(zhì)含量成正比。

    福林—酚法測(cè)定蛋白質(zhì)的反應(yīng)原理可分為兩個(gè)步驟:

    1.在堿性溶液中,蛋白質(zhì)與銅離子發(fā)生反應(yīng):

    Cu++ + 蛋白質(zhì)→ Cu-蛋白質(zhì)

    2.Cu-蛋白質(zhì)使試劑中的磷鎢酸—磷鉬酸還原成為藍(lán)色化合物,測(cè)定光吸收值就可以推算出蛋白質(zhì)的含量。試劑中的碳酸鈉有緩沖作用,使溶液的pH值保持在10左右,顯色最深。福林—酚法的靈敏度高、蛋白質(zhì)濃度測(cè)定范圍是25~250μg。

    但此法實(shí)際上是蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸等與試劑的反應(yīng),因此它受蛋白質(zhì)氨基酸組成的影響,即不同蛋白質(zhì)中氨基酸組成的不同會(huì)使顯色強(qiáng)度有所差別;此外,樣品中酚類(lèi)及檸檬酸的干擾而使結(jié)果偏高。低濃度的尿素(約0.5%左右)、胍(0.5%醫(yī).學(xué)全在線(xiàn)m.f1411.cn左右)、硫酸鈉(1%)、硝酸鈉(1%)、三氯醋酸(0.5%)、乙醇(5%)、丙酮(0.5%)對(duì)顯色無(wú)影響,上述物質(zhì)濃度高時(shí)必須做校正曲線(xiàn)。

    操作步驟:

    1.制作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)

    (1) 標(biāo)準(zhǔn)蛋白的選擇: 最好選擇與待測(cè)樣品相同或組成類(lèi)似的蛋白質(zhì)作為標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液。

    (2) 標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液的配制:將標(biāo)準(zhǔn)蛋白經(jīng)凱氏定氮法準(zhǔn)確測(cè)定其蛋白質(zhì)含量,再用無(wú)離子水配制成1.0 mg/ml的儲(chǔ)存液。

    (3) 按照表1  配成不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)蛋白組,編上號(hào)碼,以第一管為空白管,在分光光度計(jì)上測(cè)定650nm處的光密度值。

    表1  不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)蛋白組配置

    1

    2

    3

    4

    5

    6

    標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液 (0.1mg/ml)

    0

    0.2

    0.4

    0.6

    0.8

    1.0

    生理鹽水(ml)

    1.0

    0.8

    0.6

    0.4

    0.2

    0

    試劑 AB混合液(9:1)(ml)

    1

    1

    1

    1

    1

    1

       混勻后置于50℃水浴10分鐘,冷卻

    試劑C(ml)

    3.0

    3.0

    3.0

    3.0

    3.0

    3.0

    立即混勻,置50℃水浴保溫10分鐘,冷卻后比色。

    (4)  以各標(biāo)準(zhǔn)溶液濃度為橫坐標(biāo),各管的光密度值為縱坐標(biāo)作圖,作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。

    標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)必須從零點(diǎn)出發(fā),最好能成一直線(xiàn),畫(huà)好后,注明所用儀器的型號(hào)及編號(hào),所用波長(zhǎng)及測(cè)定方法,名稱(chēng)及制做日期。

    2. 樣品蛋白的測(cè)定: 取試管2只,按表2 操作。

       表2  樣品蛋白的測(cè)定

    測(cè)定管

    空白管

    稀釋待測(cè)樣品(ml)

    1.0

    -

    生理鹽水(ml)

    -

    1.0

    試劑 AB混合液(9:1)(ml)

    1

    1

       混勻后置于50℃水浴10分鐘,冷卻

    試劑C(ml)

    3.0

    3.0

      立即混勻,置50℃水浴保溫10分鐘,冷卻后比色。

        注意:各管加酚試劑必須快速,并立即搖勻,不應(yīng)出現(xiàn)渾濁;測(cè)定蛋白質(zhì)的濃度最好在15~110μg范圍。

    試劑:

    1.試劑A:2g酒石酸鉀鈉及100g Na2CO3 溶于500ml 1.0mol/L NaOH 中,用水稀釋至1000ml。

    2.試劑B:2g酒石酸鉀鈉及1g CuSO4.5H2O分別溶于少量水中,混合后加水至90ml再加1mol/L NaOH 10ml即成。

    3.試劑C:市售的酚試劑按1:15稀釋?zhuān)詈鬂舛葹?.15-0.18mol/L(用標(biāo)準(zhǔn)NaOH 滴定)。

    稱(chēng)取Na2WO4.2H2O及Na2MoO4.2H2O 各25g溶于蒸餾水700ml中,加入85% H3PO4 50ml、濃HCl 100ml,混勻后,置圓底燒瓶中加熱回流10小時(shí),加入Li2SO4.H2O 150g、蒸餾水50ml及溴水(Br2)數(shù)滴,溶液變?yōu)榧t黃色,置通風(fēng)櫥內(nèi)加熱沸騰15分鐘蒸發(fā)Br2,溶液呈透明的金黃色,冷卻后加蒸餾水定容至1000ml,過(guò)濾,置棕色瓶中保存,用標(biāo)準(zhǔn)NaOH標(biāo)定其濃度,應(yīng)用時(shí)用蒸餾水稀釋至濃度為0.15~0.18mol/L。

    溶液中的硫酸鋰能防止磷鉬酸沉淀,溴可以氧化試劑中的還原物質(zhì),使其不致干擾顯色。4.標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液:稱(chēng)量干燥的人血清白蛋白(BSA)或丙種球蛋白10mg,用生理鹽水配制成1mg/ml的標(biāo)準(zhǔn)蛋白溶液。

    5.生理鹽水。

    思考題:

    1.Lowry 法測(cè)蛋白的反應(yīng)原理及試用范圍?

    2.測(cè)量蛋白的方法有幾種?各自的優(yōu)點(diǎn)是什么?

    5

    ※<溫度、pH、激動(dòng)劑和抑制劑對(duì)酶活性的影響>

    實(shí)驗(yàn)性質(zhì):驗(yàn)證性

    實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí):4

    分組人數(shù):1

    (一)實(shí)驗(yàn)原理

    以唾液淀粉酶為例。

    1. 溫度對(duì)酶活性的影響

    (內(nèi)容原理)


    (C6H10O5)n  (C6 H10O5)    C12H22O11

    淀粉(膠體液乳狀光澤)      糊精      麥芽糖   

    (1)與碘反應(yīng)呈不同顏色,藍(lán)、紫、紅等,由淀粉斷裂而成大小不等情況而定。

    (2)不與碘呈色,淀粉空間結(jié)構(gòu)被完全破壞。 

    (3)與碘反應(yīng)呈藍(lán)色(直鏈淀粉)。  

    (技術(shù)原理)

         判斷  間接判斷  

    碘   是否水解;水解程度     淀粉酶的活性大小  

       淀粉與碘反應(yīng)后的顏色

    2. pH對(duì)酶活性的影響  唾液淀粉的最適pH為6.9。

    用碘判斷底物淀粉消失的快慢,間接判斷酶活性高低。

    3. 激動(dòng)劑、抑制劑對(duì)酶活性的影響。

    非必需激動(dòng)劑:Cl-離子

      唾液淀粉酶

    強(qiáng)烈抑制劑:Cu2+離子

     (二)操作

    1. 收集唾液

      2ml唾液

         用蒸餾水稀釋  2 ml煮沸待用  

    脫脂棉過(guò)濾,   2 ml(0℃-4℃水浴5分鐘待用)   5~10倍  濾液  其余37℃水浴保存  

        

    2. 溫度對(duì)酶活性的影響

    分組:見(jiàn)表6-36。

    6-36  溫度對(duì)酶活性的影響加樣

    步驟

    管號(hào)

       1 2   3  4  備注

    第1步   20滴 20滴  20滴 20滴   10g/L淀粉

    第2步   0℃-4℃水浴5min 37℃水浴5min   冷溫處理

    第3步   預(yù)冷唾液10滴   預(yù)冷唾液10滴  唾液10滴   煮沸唾液10滴 唾液

    第4步  攪勻0℃-4℃水浴5min   攪勻3 7℃水浴5min  冷溫處理

    第5步   2滴    37℃水浴10min 2滴   2滴  2滴   碘液 

    加唾液后應(yīng)混勻各管,加碘液后搖勻,觀察并解釋結(jié)果。

    3. pH對(duì)酶活性影響

    (1)分組:見(jiàn)表6-37。

       表6-37  pH對(duì)酶活性影響加樣

    管號(hào)

      加放試劑

    1 2   3

    磷酸鹽緩沖液   pH5.0 2 ml  pH6.8 2 ml pH8.0 2 ml

    10 g/L淀粉液   2 ml  2 ml   2 ml

    稀釋唾液   10滴  10滴  10滴


    (2)比色:取瓷比色盤(pán)一個(gè),預(yù)先在各池中分別加滴稀碘液。

    每隔1分鐘從第3管中吸取溶液1滴,加到已加有碘液的比色盤(pán)小池中,直至此管溶液與碘呈棕色向各試管加碘液2滴,搖勻觀察。

    4. 激動(dòng)劑、抑制劑對(duì)酶活性的影響

    (1)分組(試管):見(jiàn)表6-38。

    表6-38  激動(dòng)劑、抑制劑對(duì)酶活性的影響加樣

    加入試劑(滴)

    1

    2

    3

    4

    備注

    10 g/L 淀粉

    20

    20

    20

    20

    1管加激動(dòng)劑

    10 g/L NaCl

    2

    2管加抑制劑

    10 g/L CuSO4

    2

    3管為試驗(yàn)對(duì)照

    10 g/L Na2SO4

    2

    4管為系統(tǒng)空白對(duì)照

    蒸餾水

    2

    均勻置于37℃水浴

    稀釋唾液

    10

    10

    10

    10

    (2)比色:取瓷比色盤(pán)1個(gè),預(yù)先加入一排碘液,各池1~2滴。

     每隔1分鐘從第3管吸取保溫液1滴測(cè)碘反應(yīng),直至與碘呈棕色,向各試管加碘液2滴,搖勻觀察。

    (三)實(shí)驗(yàn)材料

    (1)10g/L淀粉液。

    (2)碘液:稱(chēng)取I2 1g,KI 2g,同溶于100 ml蒸餾水中,貯于棕色瓶。

    (3)10g/L NaCl。

    (4)10 g/L CuSO4

    (5)10 g/L Na2SO4。

    (6)磷酸鹽緩沖液

    1)pH 5.0,0.2mol/L磷酸氫二鈉在pH計(jì)下以0.2mol/L鹽酸調(diào)節(jié)至pH5.0。

    2)pH 6.8,1/15 mol/L磷酸氫二鈉49.6ml加入1/15 mol/L磷酸二氫鉀50.4ml。

    3)pH 8.0,1/15 mol/L磷酸氫二鈉94.7ml加入1/15 mol/L磷酸二氫鉀5.3 ml。

    (四)思考題

    系統(tǒng)歸納溫度、pH及激動(dòng)劑、抑制劑對(duì)酶活性的影響。

    5

    ※<基因組DNA的提取及鑒定>

    實(shí)驗(yàn)性質(zhì):驗(yàn)證性

    實(shí)驗(yàn)學(xué)時(shí):4

    實(shí)驗(yàn)分組人數(shù):1

    實(shí)驗(yàn)原理

    從不同組織、細(xì)胞中獲得高質(zhì)量的DNA是進(jìn)行各種研究的先決條件。DNA以核蛋白形式存在于細(xì)胞核中,制備DNA的原則是既要將蛋白質(zhì)、脂類(lèi)、糖類(lèi)等物質(zhì)分離干凈、又要盡可能保持DNA分子的完整。為了獲得大分子量的DNA,一般采用蛋白酶K和去污劑溫和處理法。

    在提取DNA的反應(yīng)體系中,SDS將細(xì)胞膜、核膜破壞,并將組蛋白等從DNA分子上拉開(kāi),SDS及EDTA抑制細(xì)胞中DNA酶的活性,蛋白酶K將所有蛋白降解成小肽和氨基酸,隨后用酚--氯仿抽提,將蛋白質(zhì)和DNA分離,得到較純的DNA分子。

    操作

    1.取動(dòng)物新鮮組織約50mg,用預(yù)冷的生理鹽水洗去表面殘血,剪碎,加入450μl STE裂解液和50μl 10%SDS至終濃度為0.5%,勻漿后再加入10mg/ml的蛋白酶K5μl至終濃度為100μg/ml, 置55℃水浴箱保溫3小時(shí)。

    2.取500μl反應(yīng)液加入等體積Tris·Cl(pH8.0)飽和酚,顛倒混勻10 min,4000rpm離心5min。

    3.取上層粘稠水相,加入酚:氯仿∶異戊醇(25:24∶1)液至1ml,顛倒混勻10min,4000rpm離心5min。

    4.取上層水相,加氯仿∶異戊醇(24∶1)液至1ml,顛倒混勻5min,4000rpm離心5min。

    5.取上層水相,加1/10體積pH5.2的3M NaAC,加入預(yù)冷的無(wú)水乙醇至1ml,緩慢搖動(dòng)混勻,可見(jiàn)乳白色絲狀DNA沉淀出現(xiàn),12000rpm離心15min。

    6.棄上清,向沉淀中加75%乙醇500μl漂洗,12000rpm離心3min。

    7.棄上清,沉淀室溫干燥,加入100μlTE溶解。

    實(shí)驗(yàn)試劑

    1.STE裂解液:

     5ml 1M Nacl

    0.5ml   1M Tris-cl   (PH8.0)

    0.1ml   0.5M EDTA  (PH8.0)

    加水定容至 50 ml。

    2、10%SDS

    3.10mg/ml蛋白酶K

    4.Tris-HCl(pH8.0)飽和酚

    5.酚:氯仿:異戊醇 (25:24:1)液

    6.氯仿:異戊醇 (24:1)

    7.3M NaAC(pH5.2)溶液

    8.冷無(wú)水乙醇

    9.75%乙醇

    10.TE: 10mM Tris-HCl(pH7.6), 1mM EDTA(pH8.0)

    注意事項(xiàng)

    1..獲得高分子質(zhì)量DNA的關(guān)鍵之一是防止DNase降解。標(biāo)本必須新鮮。在提取前,細(xì)胞應(yīng)保持完整,核和溶酶體等細(xì)胞器應(yīng)沒(méi)有明顯破壞。提取DNA用的離心管等器皿及試劑應(yīng)提前消毒,操作時(shí)要盡可能在10℃以下。在提取DNA的過(guò)程中還應(yīng)盡量避免DNA的機(jī)械剪切作用,因此在抽提過(guò)程中應(yīng)盡可能避免劇烈振蕩。

    2.除組織外,外周血白細(xì)胞、胎兒羊水細(xì)胞、胎盤(pán)以及培養(yǎng)細(xì)胞也是大量提取DNA的最適宜來(lái)源。

    思考題

    1. DNA提取過(guò)程中為什么不能劇烈震蕩。

    2. 如何進(jìn)行細(xì)胞的破碎。


    ...
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